Кофакторы и таблица «витамин → кофермент»
Кофакторы — вещества небелковой природы, необходимые большинству ферментов для каталитической активности. Две группы: ионы металлов и коферменты.
Коферменты — органические вещества, чаще всего производные витаминов; находятся в активном центре и непосредственно участвуют в катализе. Кофермент + апофермент (неактивен) = холофермент (активен).
По связи с белком:
- простетическая группа — связана ковалентно, не отделяется (ФАД, ФМН, биотин, липоевая кислота);
- косубстрат — связывается нековалентно, только в момент реакции (НАД⁺, НАДФ⁺).
Коферменты невитаминной природы: гемы, нуклеотиды, коэнзим Q, ФАФС, SAM, глутатион.
Ядро темы — таблица соответствий (тап по строке ▸ — механизм).
| Кофермент | Производное витамина | Структурная формула (рабочая группа) | Пример реакции |
|---|---|---|---|
| НАД⁺, НАДФ⁺ (никотинамидные) | PP — никотиновая кислота, никотинамид | пиридиновое кольцо с амидной группой: R–пиридин–CONH₂ | DH₂ + НАД⁺ ⇄ D + НАДН + H⁺ |
| ФАД, ФМН (флавиновые) | B₂ — рибофлавин | изоаллоксазин (два CH₃, два C=O) + рибитол | DH₂ + ФАД ⇄ D + ФАДН₂ |
| Пиридоксальфосфат (ПФ) | B₆ — пиридоксин | H₂O₃P–O–CH₂–пиридин(–CHO, –OH, –CH₃) | аланин + α-КГ ⇄ пируват + глутамат |
| Тиаминдифосфат (ТДФ) | B₁ — тиамин | тиазолиевое кольцо (N⁺, S) + пиримидин; –O–P₂O₆H₃ | пируват → CO₂ + гидроксиэтил-ТДФ |
| Биотин → карбоксибиотин | биотин (витамин H) | бицикл с S и двумя N–H; хвост –(CH₂)₄–COOH | биотин + CO₂ + АТФ → карбоксибиотин |
| Кофермент А (HS-КоА) | пантотеновая кислота | HS–КоА (рабочая группа —SH) | CH₃-COOH + HS-КоА + АТФ → ацетил-КоА + АДФ + H₃PO₄ |
| Липоамид | липоевая кислота | E–N–CO–(CH₂)₄–CH с кольцом S–S | гидроксиэтил-ТДФ + ЛК-Е → ТДФ + ацетил-ЛК-Е |
| Тетрагидрофолат (ТГФК) | фолиевая кислота | птеридин + ПАБК + глутамат | Сер + ТГФК → Гли + метилен-ТГФК |
| Кобаламины | B₁₂ | — | метилмалонил-КоА → сукцинил-КоА |
| Аскорбат ⇄ дегидроаскорбат | C — аскорбиновая кислота | лактонное кольцо с HO–C=C–OH | аскорбат ⇄ дегидроаскорбат (−2H⁺, −2e⁻) |
Тапни по строке со стрелкой ▸ — откроется пояснение.